Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tlnrd1Q9ERE8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tlnrd1Q9ERE8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tlnrd1Q9ERE8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tlnrd1Q9ERE8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlnrd1Q9ERE8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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