Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb3Q9ERD7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb3Q9ERD7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms