Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms