Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Tspan4Q9DCK3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Tspan4Q9DCK3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms