Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Csnk1dQ9DC28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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