Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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