Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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