Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chmp2aQ9DB34 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Chmp2aQ9DB34 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms