Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ift46Q9DB07 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift46Q9DB07 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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