Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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