Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb1Q9DAK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb1Q9DAK3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms