Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Subh2bvQ9D9Z7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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