Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms