Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Erp27Q9D8U3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms