Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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