Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms