Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc52a2Q9D8F3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc52a2Q9D8F3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms