Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms