Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms