Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms