Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms