Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms