Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms