Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms