Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sohlh2Q9D489 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh2Q9D489 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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