Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms