Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rasgef1cQ9D300 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rasgef1cQ9D300 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rasgef1cQ9D300 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rasgef1cQ9D300 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasgef1cQ9D300 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms