Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms