Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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