Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms