Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms