Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms