Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms