Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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