Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms