Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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