Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms