Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms