Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkrip1Q9CWV6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkrip1Q9CWV6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms