Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Khdc3Q9CWU5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Khdc3Q9CWU5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Khdc3Q9CWU5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Khdc3Q9CWU5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Khdc3Q9CWU5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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