Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx2Q9CWK8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms