Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms