Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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