Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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