Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms