Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdm1Q9CQK3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms