Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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