Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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