Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms