Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms